בבניין של חדר האוכל הראשון, הנמצא ב"חצר ראשונים", הוקם מוזאון לתולדות דגניה: מוזאון דגניה – אם הקבוצות".
בעיקרו מציג המוזאון מציג את ראשיתה של דגניה, החל מהליכתה של "הקומונה החדרתית" לאום-ג'וני וההחלטה על השם "דגניה", ועד יישוב הקבע, כולל 10 השנים הראשונות.

מטרת המוזאון – הנצחת ראשוני דגניה, שהיוו את הגרעין האנושי להגשמת רעיון הקבוצה בארץ. להראות איך קבוצת אנשים קטנה, בכוחות מוגבלים ובתנאים קשים מנשוא אבל מלאי אמונה וחזון ציוני, העמיסה  על כתפיה הרפתקה אנושית ייחודית על ידי יצירת חברה חדשה של שוויון ושיתוף, חיי עבודה ויצירה, ואחריות הדדית מלאה.
פועלם והישגיהם של הראשונים משתקפים בצילומים, במסמכים, במכתבים, במפות, בדגמים, בכתובות ובמוצגים שונים.
מוסברים יסודות חיי הקבוצה מבחינה רעיונית, ומוצגים האנשים שפעלו, חיו והשפיעו על דרכה כמו: ד"ר ארתור רופין, יוסף בוסל, א.ד. גורדון, יוסף טרומפלדור, רחל המשוררת וחברים נוספים שאמנם שמם אינו מוזכר, אבל תרומתם לדגניה שוות ערך.

תכנית התערוכה

• בחדר הראשון – "ראשית":
תקופת אום-ג'וני ובניית הבתים החדשים בנקודת הקבע.
כיום – "חצר ראשונים".

• בחדר האמצעי – פיתוח המשק:
גיוון הענפים ומעבר למשק מעורב. הכנסת ענפי בית כפתרון לבעיית עבודת החברה.

• בחדר השלישי – התפתחות הקבוצה:
הווי, חג ומועד. מפעל המים ותעשייה. הגנה וביטחון: הקרב על דגניה. השלמות, הכשרות ו"גרעינים".
דגניה כיום: היישוב והאוכלוסייה. מוסדות, ילדים ונוער. ענפי חקלאות.